＜主語＋does.＞の形で「No.3 does.」と答えるのがふつうです。

Take Bus No.3.（3番のりばのバスに乗ってください）でも話は通じますが，より口語的な表現になります。

＜Which＋名詞＋一般動詞～?＞の疑問文は「どちらの〔名詞〕が～しますか」という意味です。

[例]
　Which bus goes to the station? （どのバスが駅に行きますか？）
　No.3 does. （３番のりばのバスです）

　※答えの文は＜主語＋do[does].＞で答えます。（上の例文では，does＝goes to the station）

この文の＜which＋名詞＞は，「どちらの〔名詞〕が」という意味で〔主語〕のはたらきです。