Who runs fast?のWhoは，文の主語です。
このように疑問詞が主語のとき，疑問詞のあとは肯定文の語順となるので，do・doesは使わずにすぐ動詞が続きます。
whoは主語になると３人称・単数なので，runsのように動詞に-sをつけることにも注意しましょう。
〈ふつうの疑問詞の疑問文〉
Who do you like? 〔主語＝you〕（あなたはだれが好きですか）
→whoのあとは疑問文の語順
〈疑問詞が主語の疑問文〉
Who runs fast? 〔主語＝who〕（だれが速く走りますか）
→whoのあとは肯定文の語順