この文では，接続詞のthatが省略されています。

接続詞thatには，語と語や句と句，節と節をつなげる役割があります。

通常，１つの文の中に動詞は１つですが，ここでは接続詞thatがYou meanとYou came to Japan in January.の２つの文（節）をつないでいます。

よって，１つの文に２つの動詞があっても問題ありません。

thatを補うと
You mean that you came to Japan in January.（あなたは１月に日本に来たということを意味しています）
のようになります。

接続詞のthatは通常よく省略されるので，ここにthatがありそうだな，と予想しながら読むようにしましょう。